Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms