Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHYHD1Q5SRE7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHYHD1Q5SRE7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms