Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD3Q5JV73 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD3Q5JV73 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FRMPD3Q5JV73 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMPD3Q5JV73 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMPD3Q5JV73 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD3Q5JV73 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms