Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL8

PDZD11, PDZ domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD11Q5EBL8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDZD11Q5EBL8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDZD11Q5EBL8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDZD11Q5EBL8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZD11Q5EBL8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZD11Q5EBL8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZD11Q5EBL8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZD11Q5EBL8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZD11Q5EBL8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZD11Q5EBL8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDZD11Q5EBL8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PDZD11Q5EBL8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD11Q5EBL8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDZD11Q5EBL8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDZD11Q5EBL8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDZD11Q5EBL8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDZD11Q5EBL8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms