Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf116Q5BN46 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf116Q5BN46 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf116Q5BN46 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms