Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED5Q49AG3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED5Q49AG3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED5Q49AG3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms