Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RNF212Q495C1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RNF212Q495C1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms