Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRIT3Q3SXY7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRIT3Q3SXY7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRIT3Q3SXY7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRIT3Q3SXY7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRIT3Q3SXY7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRIT3Q3SXY7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRIT3Q3SXY7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRIT3Q3SXY7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRIT3Q3SXY7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRIT3Q3SXY7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRIT3Q3SXY7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRIT3Q3SXY7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRIT3Q3SXY7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRIT3Q3SXY7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LRIT3Q3SXY7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LRIT3Q3SXY7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRIT3Q3SXY7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRIT3Q3SXY7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRIT3Q3SXY7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRIT3Q3SXY7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRIT3Q3SXY7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRIT3Q3SXY7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRIT3Q3SXY7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms