Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LAMA4Q16363 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAMA4Q16363 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMA4Q16363 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
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