Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NTRK3Q16288 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NTRK3Q16288 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NTRK3Q16288 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
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