Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWIST1Q15672 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms