Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC9A3R2Q15599 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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SLC9A3R2Q15599 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A3R2Q15599 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A3R2Q15599 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A3R2Q15599 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A3R2Q15599 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A3R2Q15599 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC9A3R2Q15599 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC9A3R2Q15599 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC9A3R2Q15599 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC9A3R2Q15599 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC9A3R2Q15599 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC9A3R2Q15599 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC9A3R2Q15599 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC9A3R2Q15599 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC9A3R2Q15599 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A3R2Q15599 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A3R2Q15599 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A3R2Q15599 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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