Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS1Q14691 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS1Q14691 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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