Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms