Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NEUROD1Q13562 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NEUROD1Q13562 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NEUROD1Q13562 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NEUROD1Q13562 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NEUROD1Q13562 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NEUROD1Q13562 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NEUROD1Q13562 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
NEUROD1Q13562 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NEUROD1Q13562 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NEUROD1Q13562 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NEUROD1Q13562 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
NEUROD1Q13562 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NEUROD1Q13562 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NEUROD1Q13562 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NEUROD1Q13562 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NEUROD1Q13562 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NEUROD1Q13562 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NEUROD1Q13562 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NEUROD1Q13562 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NEUROD1Q13562 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
NEUROD1Q13562 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
NEUROD1Q13562 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NEUROD1Q13562 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NEUROD1Q13562 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NEUROD1Q13562 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NEUROD1Q13562 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
NEUROD1Q13562 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NEUROD1Q13562 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NEUROD1Q13562 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NEUROD1Q13562 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
NEUROD1Q13562 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NEUROD1Q13562 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NEUROD1Q13562 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NEUROD1Q13562 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NEUROD1Q13562 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NEUROD1Q13562 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NEUROD1Q13562 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NEUROD1Q13562 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NEUROD1Q13562 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NEUROD1Q13562 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
NEUROD1Q13562 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NEUROD1Q13562 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NEUROD1Q13562 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NEUROD1Q13562 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NEUROD1Q13562 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NEUROD1Q13562 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NEUROD1Q13562 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NEUROD1Q13562 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
NEUROD1Q13562 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NEUROD1Q13562 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NEUROD1Q13562 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NEUROD1Q13562 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
NEUROD1Q13562 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
NEUROD1Q13562 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NEUROD1Q13562 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
NEUROD1Q13562 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NEUROD1Q13562 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NEUROD1Q13562 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NEUROD1Q13562 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NEUROD1Q13562 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NEUROD1Q13562 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NEUROD1Q13562 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NEUROD1Q13562 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NEUROD1Q13562 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NEUROD1Q13562 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NEUROD1Q13562 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NEUROD1Q13562 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NEUROD1Q13562 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NEUROD1Q13562 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
NEUROD1Q13562 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
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