Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRQ13535 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRQ13535 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRQ13535 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRQ13535 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRQ13535 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRQ13535 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRQ13535 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRQ13535 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRQ13535 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRQ13535 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATRQ13535 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRQ13535 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRQ13535 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRQ13535 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRQ13535 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRQ13535 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRQ13535 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRQ13535 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRQ13535 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRQ13535 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRQ13535 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRQ13535 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRQ13535 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRQ13535 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRQ13535 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRQ13535 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRQ13535 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRQ13535 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRQ13535 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRQ13535 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRQ13535 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRQ13535 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRQ13535 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRQ13535 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRQ13535 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRQ13535 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRQ13535 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRQ13535 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRQ13535 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRQ13535 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATRQ13535 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRQ13535 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRQ13535 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRQ13535 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRQ13535 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRQ13535 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATRQ13535 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRQ13535 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRQ13535 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATRQ13535 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATRQ13535 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRQ13535 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRQ13535 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRQ13535 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRQ13535 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRQ13535 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRQ13535 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATRQ13535 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATRQ13535 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATRQ13535 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRQ13535 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRQ13535 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRQ13535 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRQ13535 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRQ13535 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRQ13535 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRQ13535 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRQ13535 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRQ13535 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATRQ13535 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATRQ13535 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATRQ13535 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATRQ13535 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATRQ13535 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATRQ13535 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATRQ13535 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATRQ13535 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATRQ13535 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATRQ13535 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATRQ13535 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATRQ13535 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATRQ13535 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATRQ13535 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATRQ13535 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATRQ13535 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATRQ13535 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATRQ13535 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATRQ13535 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRQ13535 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRQ13535 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRQ13535 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRQ13535 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRQ13535 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRQ13535 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRQ13535 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRQ13535 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATRQ13535 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRQ13535 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRQ13535 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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