Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SF3B2Q13435 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SF3B2Q13435 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SF3B2Q13435 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SF3B2Q13435 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SF3B2Q13435 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SF3B2Q13435 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SF3B2Q13435 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SF3B2Q13435 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SF3B2Q13435 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SF3B2Q13435 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SF3B2Q13435 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SF3B2Q13435 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SF3B2Q13435 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SF3B2Q13435 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SF3B2Q13435 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SF3B2Q13435 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SF3B2Q13435 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SF3B2Q13435 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SF3B2Q13435 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SF3B2Q13435 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SF3B2Q13435 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SF3B2Q13435 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SF3B2Q13435 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SF3B2Q13435 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SF3B2Q13435 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SF3B2Q13435 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SF3B2Q13435 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SF3B2Q13435 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SF3B2Q13435 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SF3B2Q13435 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SF3B2Q13435 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SF3B2Q13435 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SF3B2Q13435 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SF3B2Q13435 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SF3B2Q13435 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SF3B2Q13435 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SF3B2Q13435 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SF3B2Q13435 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SF3B2Q13435 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SF3B2Q13435 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SF3B2Q13435 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SF3B2Q13435 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SF3B2Q13435 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SF3B2Q13435 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SF3B2Q13435 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SF3B2Q13435 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SF3B2Q13435 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SF3B2Q13435 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SF3B2Q13435 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SF3B2Q13435 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SF3B2Q13435 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SF3B2Q13435 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
SF3B2Q13435 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SF3B2Q13435 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SF3B2Q13435 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SF3B2Q13435 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SF3B2Q13435 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SF3B2Q13435 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SF3B2Q13435 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SF3B2Q13435 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SF3B2Q13435 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SF3B2Q13435 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
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