Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRP1Q07954 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRP1Q07954 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRP1Q07954 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP1Q07954 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP1Q07954 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP1Q07954 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP1Q07954 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP1Q07954 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP1Q07954 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRP1Q07954 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRP1Q07954 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP1Q07954 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP1Q07954 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP1Q07954 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP1Q07954 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP1Q07954 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP1Q07954 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP1Q07954 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP1Q07954 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRP1Q07954 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP1Q07954 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP1Q07954 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP1Q07954 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LRP1Q07954 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LRP1Q07954 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRP1Q07954 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP1Q07954 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRP1Q07954 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRP1Q07954 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LRP1Q07954 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP1Q07954 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRP1Q07954 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP1Q07954 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP1Q07954 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP1Q07954 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP1Q07954 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP1Q07954 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP1Q07954 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP1Q07954 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP1Q07954 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRP1Q07954 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LRP1Q07954 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LRP1Q07954 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LRP1Q07954 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRP1Q07954 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms