Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CKAP4Q07065 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CKAP4Q07065 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CKAP4Q07065 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CKAP4Q07065 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CKAP4Q07065 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CKAP4Q07065 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CKAP4Q07065 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CKAP4Q07065 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CKAP4Q07065 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CKAP4Q07065 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CKAP4Q07065 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CKAP4Q07065 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CKAP4Q07065 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CKAP4Q07065 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CKAP4Q07065 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CKAP4Q07065 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CKAP4Q07065 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CKAP4Q07065 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CKAP4Q07065 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CKAP4Q07065 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CKAP4Q07065 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CKAP4Q07065 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CKAP4Q07065 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CKAP4Q07065 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CKAP4Q07065 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CKAP4Q07065 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CKAP4Q07065 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CKAP4Q07065 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CKAP4Q07065 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CKAP4Q07065 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CKAP4Q07065 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CKAP4Q07065 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CKAP4Q07065 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CKAP4Q07065 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CKAP4Q07065 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CKAP4Q07065 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CKAP4Q07065 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CKAP4Q07065 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CKAP4Q07065 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CKAP4Q07065 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CKAP4Q07065 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CKAP4Q07065 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CKAP4Q07065 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CKAP4Q07065 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CKAP4Q07065 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CKAP4Q07065 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CKAP4Q07065 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CKAP4Q07065 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CKAP4Q07065 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CKAP4Q07065 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CKAP4Q07065 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CKAP4Q07065 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CKAP4Q07065 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CKAP4Q07065 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CKAP4Q07065 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CKAP4Q07065 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CKAP4Q07065 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CKAP4Q07065 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CKAP4Q07065 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CKAP4Q07065 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms