Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RUNX1T1Q06455 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNX1T1Q06455 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNX1T1Q06455 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms