Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITPNAQ00169 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITPNAQ00169 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PITPNAQ00169 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms