Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN10P78369 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN10P78369 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN10P78369 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN10P78369 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN10P78369 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLDN10P78369 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLDN10P78369 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLDN10P78369 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN10P78369 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN10P78369 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN10P78369 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN10P78369 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CLDN10P78369 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDN10P78369 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLDN10P78369 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLDN10P78369 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN10P78369 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN10P78369 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN10P78369 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN10P78369 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN10P78369 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN10P78369 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN10P78369 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN10P78369 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN10P78369 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN10P78369 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN10P78369 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN10P78369 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN10P78369 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDN10P78369 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDN10P78369 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDN10P78369 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDN10P78369 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms