Protein–RNA interactions for Protein: P78344

EIF4G2, Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4G2P78344 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 49.3
EIF4G2P78344 TNS1-209ENST00000446688 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.271e-8■■■■■ 49.3
EIF4G2P78344 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.511e-8■■■■■ 49.3
EIF4G2P78344 TCF3-210ENST00000587235 986 ntTSL 535.01■■■■□ 3.23e-7■■■■■ 49.2
EIF4G2P78344 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.423e-7■■■■■ 49.2
EIF4G2P78344 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.373e-7■■■■■ 49.2
EIF4G2P78344 TCF3-208ENST00000586318 631 ntTSL 323.52■■□□□ 1.363e-7■■■■■ 49.2
EIF4G2P78344 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.333e-7■■■■■ 49.2
EIF4G2P78344 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.513e-7■■■■■ 49.2
EIF4G2P78344 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.493e-7■■■■■ 49.2
EIF4G2P78344 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.463e-7■■■■■ 49.2
EIF4G2P78344 OSBPL5-212ENST00000528124 567 ntTSL 425.47■■□□□ 1.671e-11■■■■■ 49.2
EIF4G2P78344 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.291e-6■■■■■ 49.1
EIF4G2P78344 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.791e-6■■■■■ 49.1
EIF4G2P78344 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.461e-6■■■■■ 49.1
EIF4G2P78344 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.421e-6■■■■■ 49.1
EIF4G2P78344 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.951e-6■■■■■ 49.1
EIF4G2P78344 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.218e-10■■■■■ 49.1
EIF4G2P78344 AC005307.1-201ENST00000567877 1570 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.244e-13■■■■■ 49
EIF4G2P78344 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 49
EIF4G2P78344 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 49
EIF4G2P78344 ACTN1-220ENST00000556433 1259 ntTSL 331.27■■■□□ 2.66e-7■■■■■ 48.9
EIF4G2P78344 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.796e-7■■■■■ 48.9
EIF4G2P78344 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.546e-7■■■■■ 48.9
EIF4G2P78344 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.516e-7■■■■■ 48.9
EIF4G2P78344 ACTN1-201ENST00000193403 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.046e-7■■■■■ 48.9
EIF4G2P78344 ACTN1-203ENST00000394419 3464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 48.9
EIF4G2P78344 ACTN1-215ENST00000555616 919 ntTSL 313.37□□□□□ -0.276e-7■■■■■ 48.9
EIF4G2P78344 ACTN1-213ENST00000554508 585 ntTSL 412.13□□□□□ -0.476e-7■■■■■ 48.9
EIF4G2P78344 AC099489.1-207ENST00000595170 3552 ntTSL 218.07■□□□□ 0.482e-8■■■■■ 48.8
EIF4G2P78344 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 48.8
EIF4G2P78344 LINC00923-201ENST00000503768 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.451e-11■■■■■ 48.5
EIF4G2P78344 LINC00923-202ENST00000503874 1460 ntTSL 1 (best)17.09■□□□□ 0.331e-11■■■■■ 48.5
EIF4G2P78344 LINC00923-204ENST00000614972 1181 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.741e-11■■■■■ 48.5
EIF4G2P78344 JRK-208ENST00000591357 571 ntTSL 429.53■■■□□ 2.324e-6■■■■■ 48.5
EIF4G2P78344 JRK-201ENST00000503272 587 ntTSL 422.72■■□□□ 1.234e-6■■■■■ 48.5
EIF4G2P78344 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.174e-6■■■■■ 48.5
EIF4G2P78344 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.144e-6■■■■■ 48.5
EIF4G2P78344 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.854e-6■■■■■ 48.5
EIF4G2P78344 TMEM131L-204ENST00000445960 538 ntTSL 424.47■■□□□ 1.517e-7■■■■■ 48.5
EIF4G2P78344 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.547e-7■■■■■ 48.5
EIF4G2P78344 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.477e-7■■■■■ 48.5
EIF4G2P78344 ERICH1-211ENST00000524138 682 ntTSL 321.83■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 48.5
EIF4G2P78344 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.032e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.792e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.262e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.932e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.742e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.572e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.522e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 DPY19L3-201ENST00000342179 6015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.132e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 ALDH1A2-207ENST00000558231 1664 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.012e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 RFWD2-203ENST00000367667 2034 ntTSL 1 (best)15.09■□□□□ 0.012e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 ALDH1A2-202ENST00000347587 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.042e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 ASAP1-215ENST00000524299 550 ntTSL 414.71□□□□□ -0.052e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 ALDH1A2-217ENST00000559517 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.222e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 ALDH1A2-203ENST00000430119 3049 ntTSL 213.45□□□□□ -0.262e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 DPY19L3-205ENST00000586987 5925 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.62e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 DPY19L3-209ENST00000592142 5968 ntTSL 1 (best)10.34□□□□□ -0.752e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 RFWD2-206ENST00000461830 2131 ntTSL 510.15□□□□□ -0.782e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 ASAP1-212ENST00000521426 566 ntTSL 49.98□□□□□ -0.812e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.832e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 ASAP1-216ENST00000524367 962 ntTSL 59.18□□□□□ -0.942e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 ASAP1-209ENST00000520927 742 ntTSL 58.84□□□□□ -0.992e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 ASAP1-211ENST00000521075 5406 ntTSL 1 (best)8.14□□□□□ -1.112e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 RFWD2-202ENST00000367666 2022 ntTSL 26.99□□□□□ -1.292e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC23.17■■□□□ 1.36e-11■■■■■ 48.4
EIF4G2P78344 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.034e-9■■■■■ 48.3
EIF4G2P78344 PHF19-213ENST00000487555 1092 ntTSL 1 (best)20.68■□□□□ 0.94e-9■■■■■ 48.3
EIF4G2P78344 PHF19-208ENST00000462229 550 ntTSL 219.54■□□□□ 0.724e-9■■■■■ 48.3
EIF4G2P78344 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.247e-8■■■■■ 48.1
EIF4G2P78344 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.897e-8■■■■■ 48.1
EIF4G2P78344 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.497e-8■■■■■ 48.1
EIF4G2P78344 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.577e-8■■■■■ 48.1
EIF4G2P78344 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.681e-8■■■■■ 48
EIF4G2P78344 AGPAT3-206ENST00000422850 1003 ntTSL 522.09■■□□□ 1.131e-7■■■■■ 48
EIF4G2P78344 AGPAT3-210ENST00000457068 924 ntTSL 322.09■■□□□ 1.131e-7■■■■■ 48
EIF4G2P78344 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.874e-7■■■■■ 47.9
EIF4G2P78344 NOC2L-203ENST00000477976 4201 ntTSL 515.78■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 47.9
EIF4G2P78344 ADARB1-209ENST00000464215 389 ntTSL 310.06□□□□□ -0.86e-7■■■■■ 47.8
EIF4G2P78344 NUP210-202ENST00000420141 3134 ntTSL 1 (best)31.69■■■□□ 2.665e-7■■■■■ 47.8
EIF4G2P78344 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.675e-7■■■■■ 47.8
EIF4G2P78344 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.881e-7■■■■■ 47.6
EIF4G2P78344 DSCR4-202ENST00000398948 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.492e-15■■■■■ 47.6
EIF4G2P78344 PISD-210ENST00000442379 722 ntTSL 219.11■□□□□ 0.654e-8■■■■■ 47.5
EIF4G2P78344 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC17.05■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 47.5
EIF4G2P78344 AACSP1-201ENST00000503486 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 47.5
EIF4G2P78344 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.471e-9■■■■■ 47.3
EIF4G2P78344 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.131e-9■■■■■ 47.3
EIF4G2P78344 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.021e-9■■■■■ 47.3
EIF4G2P78344 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.931e-9■■■■■ 47.3
EIF4G2P78344 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.871e-9■■■■■ 47.3
EIF4G2P78344 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.421e-9■■■■■ 47.3
EIF4G2P78344 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC19.34■□□□□ 0.699e-7■■■■■ 47.3
EIF4G2P78344 Z84723.1-201ENST00000568710 773 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.269e-7■■■■■ 47.3
EIF4G2P78344 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.932e-21■■■■■ 47.2
EIF4G2P78344 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.72e-21■■■■■ 47.2
EIF4G2P78344 WHRN-204ENST00000374059 3278 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.042e-21■■■■■ 47.2
EIF4G2P78344 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.742e-12■■■■■ 47.2
EIF4G2P78344 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.384e-7■■■■■ 47.2
Retrieved 100 of 8,962 protein–RNA pairs in 157.9 ms