Protein–RNA interactions for Protein: P78324

SIRPA, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPAP78324 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRPAP78324 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPAP78324 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms