Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3S2P59780 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3S2P59780 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AP3S2P59780 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3S2P59780 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3S2P59780 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP3S2P59780 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AP3S2P59780 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3S2P59780 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3S2P59780 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3S2P59780 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3S2P59780 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3S2P59780 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3S2P59780 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3S2P59780 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3S2P59780 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3S2P59780 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3S2P59780 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AP3S2P59780 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3S2P59780 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3S2P59780 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3S2P59780 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3S2P59780 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3S2P59780 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3S2P59780 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3S2P59780 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3S2P59780 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms