Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN8P56748 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN8P56748 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN8P56748 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN8P56748 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN8P56748 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN8P56748 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN8P56748 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN8P56748 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN8P56748 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN8P56748 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN8P56748 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN8P56748 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN8P56748 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN8P56748 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN8P56748 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN8P56748 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN8P56748 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN8P56748 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN8P56748 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN8P56748 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN8P56748 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN8P56748 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN8P56748 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN8P56748 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN8P56748 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN8P56748 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN8P56748 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN8P56748 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN8P56748 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN8P56748 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN8P56748 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN8P56748 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN8P56748 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN8P56748 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN8P56748 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN8P56748 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN8P56748 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms