Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA8P53708 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA8P53708 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA8P53708 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA8P53708 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA8P53708 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA8P53708 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA8P53708 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA8P53708 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA8P53708 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA8P53708 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA8P53708 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITGA8P53708 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA8P53708 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA8P53708 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms