Protein–RNA interactions for Protein: P49459

UBE2A, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2AP49459 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBE2AP49459 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBE2AP49459 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
UBE2AP49459 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBE2AP49459 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBE2AP49459 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBE2AP49459 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2AP49459 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms