Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
KDM5CP41229 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
KDM5CP41229 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
KDM5CP41229 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
KDM5CP41229 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
KDM5CP41229 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
KDM5CP41229 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
KDM5CP41229 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
KDM5CP41229 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
KDM5CP41229 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
KDM5CP41229 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
KDM5CP41229 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
KDM5CP41229 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
KDM5CP41229 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
KDM5CP41229 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
KDM5CP41229 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
KDM5CP41229 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC38.1■■■■□ 3.69
KDM5CP41229 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
KDM5CP41229 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
KDM5CP41229 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
KDM5CP41229 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
KDM5CP41229 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
KDM5CP41229 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
KDM5CP41229 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
KDM5CP41229 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
KDM5CP41229 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
KDM5CP41229 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
KDM5CP41229 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
KDM5CP41229 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
KDM5CP41229 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
KDM5CP41229 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
KDM5CP41229 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
KDM5CP41229 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
KDM5CP41229 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
KDM5CP41229 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
KDM5CP41229 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
KDM5CP41229 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
KDM5CP41229 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
KDM5CP41229 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
KDM5CP41229 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
KDM5CP41229 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
KDM5CP41229 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
KDM5CP41229 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
KDM5CP41229 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
KDM5CP41229 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC38■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
KDM5CP41229 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
KDM5CP41229 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
KDM5CP41229 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
KDM5CP41229 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.93■■■■□ 3.66
KDM5CP41229 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms