Protein–RNA interactions for Protein: P40926

MDH2, Malate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH2P40926 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDH2P40926 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDH2P40926 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDH2P40926 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDH2P40926 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDH2P40926 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDH2P40926 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH2P40926 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH2P40926 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH2P40926 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH2P40926 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH2P40926 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH2P40926 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH2P40926 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH2P40926 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH2P40926 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH2P40926 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH2P40926 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH2P40926 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH2P40926 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH2P40926 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH2P40926 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDH2P40926 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDH2P40926 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDH2P40926 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDH2P40926 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDH2P40926 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MDH2P40926 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDH2P40926 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDH2P40926 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDH2P40926 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDH2P40926 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDH2P40926 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDH2P40926 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDH2P40926 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MDH2P40926 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MDH2P40926 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDH2P40926 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDH2P40926 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDH2P40926 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDH2P40926 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDH2P40926 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDH2P40926 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MDH2P40926 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDH2P40926 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDH2P40926 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDH2P40926 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDH2P40926 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MDH2P40926 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MDH2P40926 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MDH2P40926 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MDH2P40926 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDH2P40926 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDH2P40926 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDH2P40926 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDH2P40926 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDH2P40926 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDH2P40926 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MDH2P40926 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDH2P40926 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDH2P40926 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDH2P40926 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDH2P40926 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDH2P40926 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDH2P40926 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDH2P40926 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDH2P40926 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDH2P40926 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDH2P40926 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDH2P40926 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDH2P40926 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDH2P40926 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDH2P40926 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDH2P40926 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDH2P40926 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDH2P40926 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDH2P40926 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDH2P40926 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH2P40926 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH2P40926 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH2P40926 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH2P40926 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH2P40926 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH2P40926 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH2P40926 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH2P40926 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDH2P40926 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH2P40926 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH2P40926 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH2P40926 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH2P40926 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH2P40926 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH2P40926 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH2P40926 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDH2P40926 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDH2P40926 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDH2P40926 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDH2P40926 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDH2P40926 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDH2P40926 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms