Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TGFBR1P36897 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGFBR1P36897 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGFBR1P36897 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms