Protein–RNA interactions for Protein: P30154

PPP2R1B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R1BP30154 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP2R1BP30154 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP2R1BP30154 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP2R1BP30154 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP2R1BP30154 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP2R1BP30154 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP2R1BP30154 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP2R1BP30154 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP2R1BP30154 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP2R1BP30154 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP2R1BP30154 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP2R1BP30154 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP2R1BP30154 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP2R1BP30154 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms