Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTPRMP28827 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTPRMP28827 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTPRMP28827 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PTPRMP28827 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
PTPRMP28827 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PTPRMP28827 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PTPRMP28827 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
PTPRMP28827 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRMP28827 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRMP28827 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRMP28827 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRMP28827 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRMP28827 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRMP28827 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PTPRMP28827 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PTPRMP28827 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
PTPRMP28827 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PTPRMP28827 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PTPRMP28827 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PTPRMP28827 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
PTPRMP28827 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PTPRMP28827 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PTPRMP28827 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PTPRMP28827 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PTPRMP28827 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PTPRMP28827 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PTPRMP28827 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PTPRMP28827 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PTPRMP28827 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPRMP28827 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPRMP28827 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
PTPRMP28827 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PTPRMP28827 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPRMP28827 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPRMP28827 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPRMP28827 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPRMP28827 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
PTPRMP28827 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTPRMP28827 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTPRMP28827 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PTPRMP28827 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PTPRMP28827 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PTPRMP28827 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
PTPRMP28827 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PTPRMP28827 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRMP28827 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRMP28827 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRMP28827 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRMP28827 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRMP28827 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRMP28827 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRMP28827 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRMP28827 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRMP28827 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRMP28827 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRMP28827 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
PTPRMP28827 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
PTPRMP28827 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
PTPRMP28827 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRMP28827 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRMP28827 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRMP28827 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PTPRMP28827 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PTPRMP28827 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PTPRMP28827 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
PTPRMP28827 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PTPRMP28827 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PTPRMP28827 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPRMP28827 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPRMP28827 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PTPRMP28827 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PTPRMP28827 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PTPRMP28827 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PTPRMP28827 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
PTPRMP28827 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PTPRMP28827 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PTPRMP28827 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
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