Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP24386 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP24386 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP24386 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP24386 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP24386 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP24386 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP24386 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP24386 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP24386 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP24386 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP24386 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP24386 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP24386 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP24386 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP24386 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP24386 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP24386 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP24386 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP24386 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP24386 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP24386 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP24386 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP24386 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP24386 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP24386 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP24386 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP24386 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP24386 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP24386 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP24386 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP24386 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP24386 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP24386 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP24386 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP24386 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP24386 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP24386 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP24386 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP24386 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP24386 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP24386 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP24386 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP24386 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP24386 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP24386 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP24386 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP24386 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP24386 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP24386 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP24386 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP24386 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP24386 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP24386 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP24386 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP24386 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP24386 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP24386 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP24386 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP24386 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP24386 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP24386 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP24386 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP24386 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP24386 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP24386 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP24386 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP24386 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP24386 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP24386 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP24386 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP24386 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP24386 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP24386 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP24386 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP24386 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP24386 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP24386 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP24386 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP24386 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP24386 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP24386 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP24386 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP24386 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP24386 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP24386 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP24386 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP24386 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP24386 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP24386 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP24386 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP24386 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP24386 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP24386 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP24386 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP24386 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP24386 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP24386 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP24386 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP24386 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms