Protein–RNA interactions for Protein: P23759

PAX7, Paired box protein Pax-7, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX7P23759 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAX7P23759 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAX7P23759 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAX7P23759 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAX7P23759 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAX7P23759 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAX7P23759 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAX7P23759 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAX7P23759 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAX7P23759 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAX7P23759 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PAX7P23759 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PAX7P23759 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAX7P23759 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAX7P23759 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAX7P23759 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAX7P23759 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAX7P23759 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAX7P23759 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAX7P23759 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAX7P23759 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAX7P23759 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAX7P23759 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAX7P23759 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAX7P23759 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAX7P23759 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAX7P23759 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAX7P23759 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAX7P23759 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAX7P23759 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAX7P23759 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAX7P23759 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAX7P23759 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAX7P23759 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAX7P23759 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAX7P23759 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAX7P23759 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAX7P23759 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAX7P23759 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAX7P23759 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAX7P23759 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAX7P23759 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAX7P23759 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAX7P23759 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAX7P23759 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAX7P23759 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAX7P23759 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PAX7P23759 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAX7P23759 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAX7P23759 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAX7P23759 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAX7P23759 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAX7P23759 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAX7P23759 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PAX7P23759 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAX7P23759 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAX7P23759 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAX7P23759 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAX7P23759 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX7P23759 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX7P23759 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX7P23759 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PAX7P23759 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PAX7P23759 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAX7P23759 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PAX7P23759 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAX7P23759 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAX7P23759 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAX7P23759 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAX7P23759 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAX7P23759 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAX7P23759 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAX7P23759 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX7P23759 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX7P23759 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX7P23759 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX7P23759 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX7P23759 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX7P23759 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX7P23759 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX7P23759 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAX7P23759 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAX7P23759 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAX7P23759 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAX7P23759 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAX7P23759 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAX7P23759 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX7P23759 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX7P23759 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX7P23759 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX7P23759 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX7P23759 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX7P23759 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX7P23759 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX7P23759 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX7P23759 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAX7P23759 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PAX7P23759 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAX7P23759 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAX7P23759 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms