Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYF6P23409 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYF6P23409 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYF6P23409 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYF6P23409 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYF6P23409 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYF6P23409 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYF6P23409 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYF6P23409 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYF6P23409 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYF6P23409 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYF6P23409 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYF6P23409 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYF6P23409 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYF6P23409 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYF6P23409 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYF6P23409 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYF6P23409 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYF6P23409 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYF6P23409 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYF6P23409 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYF6P23409 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYF6P23409 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYF6P23409 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYF6P23409 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYF6P23409 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYF6P23409 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYF6P23409 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYF6P23409 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYF6P23409 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYF6P23409 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYF6P23409 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYF6P23409 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYF6P23409 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYF6P23409 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYF6P23409 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYF6P23409 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYF6P23409 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYF6P23409 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYF6P23409 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYF6P23409 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYF6P23409 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYF6P23409 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYF6P23409 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYF6P23409 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYF6P23409 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYF6P23409 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYF6P23409 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MYF6P23409 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYF6P23409 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYF6P23409 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYF6P23409 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYF6P23409 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYF6P23409 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYF6P23409 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYF6P23409 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYF6P23409 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYF6P23409 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYF6P23409 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYF6P23409 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYF6P23409 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYF6P23409 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MYF6P23409 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYF6P23409 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYF6P23409 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYF6P23409 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYF6P23409 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYF6P23409 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MYF6P23409 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYF6P23409 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYF6P23409 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYF6P23409 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYF6P23409 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYF6P23409 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYF6P23409 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYF6P23409 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYF6P23409 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYF6P23409 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYF6P23409 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYF6P23409 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYF6P23409 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYF6P23409 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYF6P23409 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYF6P23409 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MYF6P23409 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYF6P23409 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYF6P23409 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYF6P23409 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYF6P23409 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYF6P23409 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYF6P23409 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYF6P23409 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYF6P23409 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYF6P23409 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYF6P23409 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYF6P23409 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYF6P23409 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYF6P23409 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYF6P23409 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYF6P23409 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms