Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTF3P20783 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTF3P20783 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTF3P20783 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTF3P20783 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTF3P20783 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTF3P20783 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NTF3P20783 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTF3P20783 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NTF3P20783 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTF3P20783 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTF3P20783 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NTF3P20783 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTF3P20783 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTF3P20783 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTF3P20783 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTF3P20783 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTF3P20783 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTF3P20783 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTF3P20783 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTF3P20783 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTF3P20783 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTF3P20783 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTF3P20783 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTF3P20783 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTF3P20783 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTF3P20783 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTF3P20783 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTF3P20783 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTF3P20783 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTF3P20783 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTF3P20783 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTF3P20783 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTF3P20783 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTF3P20783 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTF3P20783 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTF3P20783 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTF3P20783 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTF3P20783 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTF3P20783 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTF3P20783 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTF3P20783 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTF3P20783 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTF3P20783 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTF3P20783 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTF3P20783 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTF3P20783 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTF3P20783 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTF3P20783 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTF3P20783 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTF3P20783 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTF3P20783 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTF3P20783 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTF3P20783 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTF3P20783 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTF3P20783 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTF3P20783 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTF3P20783 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTF3P20783 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTF3P20783 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTF3P20783 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTF3P20783 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTF3P20783 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTF3P20783 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTF3P20783 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTF3P20783 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTF3P20783 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTF3P20783 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTF3P20783 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTF3P20783 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NTF3P20783 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTF3P20783 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTF3P20783 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NTF3P20783 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTF3P20783 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTF3P20783 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTF3P20783 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTF3P20783 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTF3P20783 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTF3P20783 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTF3P20783 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTF3P20783 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NTF3P20783 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTF3P20783 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTF3P20783 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTF3P20783 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTF3P20783 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NTF3P20783 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTF3P20783 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTF3P20783 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTF3P20783 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTF3P20783 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTF3P20783 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTF3P20783 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTF3P20783 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTF3P20783 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTF3P20783 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTF3P20783 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTF3P20783 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTF3P20783 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms