Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3AP20336 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3AP20336 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3AP20336 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3AP20336 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms