Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB1P18505 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRB1P18505 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms