Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSPP15924 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSPP15924 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSPP15924 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DSPP15924 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSPP15924 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSPP15924 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSPP15924 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSPP15924 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSPP15924 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSPP15924 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DSPP15924 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSPP15924 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSPP15924 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DSPP15924 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSPP15924 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSPP15924 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSPP15924 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DSPP15924 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSPP15924 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSPP15924 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DSPP15924 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DSPP15924 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSPP15924 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSPP15924 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSPP15924 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSPP15924 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSPP15924 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSPP15924 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSPP15924 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSPP15924 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSPP15924 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSPP15924 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSPP15924 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DSPP15924 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DSPP15924 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSPP15924 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DSPP15924 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSPP15924 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSPP15924 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSPP15924 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSPP15924 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSPP15924 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSPP15924 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSPP15924 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSPP15924 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSPP15924 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DSPP15924 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSPP15924 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSPP15924 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSPP15924 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSPP15924 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DSPP15924 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSPP15924 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DSPP15924 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSPP15924 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSPP15924 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSPP15924 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSPP15924 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSPP15924 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSPP15924 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSPP15924 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSPP15924 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSPP15924 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSPP15924 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSPP15924 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSPP15924 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSPP15924 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSPP15924 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSPP15924 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSPP15924 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSPP15924 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSPP15924 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSPP15924 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSPP15924 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSPP15924 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSPP15924 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSPP15924 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSPP15924 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSPP15924 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSPP15924 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DSPP15924 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSPP15924 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSPP15924 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSPP15924 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSPP15924 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSPP15924 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSPP15924 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSPP15924 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSPP15924 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSPP15924 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSPP15924 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSPP15924 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSPP15924 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSPP15924 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSPP15924 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSPP15924 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSPP15924 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSPP15924 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSPP15924 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms