Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEPDP12955 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEPDP12955 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PEPDP12955 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEPDP12955 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEPDP12955 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEPDP12955 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEPDP12955 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEPDP12955 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEPDP12955 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEPDP12955 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEPDP12955 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEPDP12955 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEPDP12955 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEPDP12955 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEPDP12955 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEPDP12955 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEPDP12955 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEPDP12955 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEPDP12955 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEPDP12955 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEPDP12955 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEPDP12955 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEPDP12955 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEPDP12955 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEPDP12955 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEPDP12955 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PEPDP12955 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEPDP12955 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEPDP12955 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEPDP12955 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEPDP12955 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEPDP12955 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEPDP12955 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEPDP12955 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEPDP12955 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEPDP12955 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEPDP12955 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEPDP12955 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEPDP12955 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEPDP12955 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEPDP12955 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEPDP12955 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEPDP12955 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEPDP12955 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEPDP12955 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEPDP12955 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEPDP12955 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEPDP12955 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEPDP12955 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEPDP12955 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEPDP12955 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEPDP12955 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEPDP12955 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEPDP12955 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEPDP12955 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEPDP12955 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEPDP12955 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEPDP12955 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEPDP12955 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEPDP12955 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEPDP12955 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEPDP12955 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEPDP12955 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEPDP12955 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEPDP12955 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEPDP12955 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEPDP12955 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEPDP12955 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEPDP12955 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PEPDP12955 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PEPDP12955 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEPDP12955 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEPDP12955 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEPDP12955 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEPDP12955 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEPDP12955 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEPDP12955 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEPDP12955 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEPDP12955 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEPDP12955 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEPDP12955 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEPDP12955 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEPDP12955 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEPDP12955 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEPDP12955 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEPDP12955 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEPDP12955 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEPDP12955 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEPDP12955 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEPDP12955 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEPDP12955 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PEPDP12955 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEPDP12955 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEPDP12955 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEPDP12955 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEPDP12955 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEPDP12955 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEPDP12955 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEPDP12955 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms