Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFTPCP11686 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPCP11686 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms