Protein–RNA interactions for Protein: P0DP72

VSIG10L2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10L2P0DP72 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
VSIG10L2P0DP72 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VSIG10L2P0DP72 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VSIG10L2P0DP72 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VSIG10L2P0DP72 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VSIG10L2P0DP72 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VSIG10L2P0DP72 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VSIG10L2P0DP72 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VSIG10L2P0DP72 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VSIG10L2P0DP72 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VSIG10L2P0DP72 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VSIG10L2P0DP72 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VSIG10L2P0DP72 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VSIG10L2P0DP72 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VSIG10L2P0DP72 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VSIG10L2P0DP72 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VSIG10L2P0DP72 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VSIG10L2P0DP72 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VSIG10L2P0DP72 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VSIG10L2P0DP72 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VSIG10L2P0DP72 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VSIG10L2P0DP72 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VSIG10L2P0DP72 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VSIG10L2P0DP72 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VSIG10L2P0DP72 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms