Protein–RNA interactions for Protein: P0CG40

SP9, Transcription factor Sp9, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP9P0CG40 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP9P0CG40 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP9P0CG40 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SP9P0CG40 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SP9P0CG40 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP9P0CG40 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SP9P0CG40 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP9P0CG40 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP9P0CG40 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP9P0CG40 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP9P0CG40 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP9P0CG40 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP9P0CG40 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms