Protein–RNA interactions for Protein: P08574

CYC1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYC1P08574 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYC1P08574 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CYC1P08574 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYC1P08574 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYC1P08574 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYC1P08574 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYC1P08574 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYC1P08574 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYC1P08574 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYC1P08574 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYC1P08574 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYC1P08574 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYC1P08574 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYC1P08574 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYC1P08574 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYC1P08574 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYC1P08574 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYC1P08574 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYC1P08574 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYC1P08574 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYC1P08574 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYC1P08574 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYC1P08574 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYC1P08574 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYC1P08574 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYC1P08574 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYC1P08574 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYC1P08574 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYC1P08574 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYC1P08574 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYC1P08574 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYC1P08574 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CYC1P08574 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYC1P08574 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYC1P08574 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYC1P08574 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYC1P08574 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYC1P08574 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYC1P08574 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYC1P08574 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYC1P08574 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYC1P08574 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYC1P08574 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYC1P08574 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYC1P08574 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYC1P08574 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYC1P08574 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYC1P08574 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CYC1P08574 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CYC1P08574 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYC1P08574 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYC1P08574 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYC1P08574 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYC1P08574 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYC1P08574 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYC1P08574 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYC1P08574 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CYC1P08574 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CYC1P08574 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYC1P08574 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CYC1P08574 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYC1P08574 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYC1P08574 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYC1P08574 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYC1P08574 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYC1P08574 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYC1P08574 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYC1P08574 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYC1P08574 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CYC1P08574 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYC1P08574 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYC1P08574 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYC1P08574 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CYC1P08574 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYC1P08574 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYC1P08574 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYC1P08574 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYC1P08574 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYC1P08574 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYC1P08574 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYC1P08574 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYC1P08574 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYC1P08574 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYC1P08574 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYC1P08574 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYC1P08574 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYC1P08574 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYC1P08574 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYC1P08574 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CYC1P08574 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYC1P08574 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYC1P08574 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYC1P08574 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYC1P08574 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYC1P08574 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYC1P08574 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYC1P08574 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYC1P08574 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYC1P08574 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYC1P08574 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms