Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
HSP90AB1P08238 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
HSP90AB1P08238 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
HSP90AB1P08238 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
HSP90AB1P08238 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
HSP90AB1P08238 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
HSP90AB1P08238 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HSP90AB1P08238 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
HSP90AB1P08238 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
HSP90AB1P08238 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HSP90AB1P08238 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HSP90AB1P08238 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
HSP90AB1P08238 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HSP90AB1P08238 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
HSP90AB1P08238 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HSP90AB1P08238 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
HSP90AB1P08238 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
HSP90AB1P08238 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
HSP90AB1P08238 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
HSP90AB1P08238 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
HSP90AB1P08238 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
HSP90AB1P08238 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
HSP90AB1P08238 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HSP90AB1P08238 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HSP90AB1P08238 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
HSP90AB1P08238 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HSP90AB1P08238 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HSP90AB1P08238 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HSP90AB1P08238 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HSP90AB1P08238 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
HSP90AB1P08238 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HSP90AB1P08238 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HSP90AB1P08238 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HSP90AB1P08238 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HSP90AB1P08238 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
HSP90AB1P08238 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
HSP90AB1P08238 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
HSP90AB1P08238 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
HSP90AB1P08238 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HSP90AB1P08238 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
HSP90AB1P08238 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms