Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEFLP07196 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEFLP07196 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NEFLP07196 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NEFLP07196 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NEFLP07196 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NEFLP07196 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NEFLP07196 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEFLP07196 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEFLP07196 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEFLP07196 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEFLP07196 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEFLP07196 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEFLP07196 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NEFLP07196 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NEFLP07196 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NEFLP07196 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NEFLP07196 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEFLP07196 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEFLP07196 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEFLP07196 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEFLP07196 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEFLP07196 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEFLP07196 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEFLP07196 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
NEFLP07196 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEFLP07196 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEFLP07196 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEFLP07196 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEFLP07196 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEFLP07196 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEFLP07196 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEFLP07196 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEFLP07196 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NEFLP07196 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NEFLP07196 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NEFLP07196 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NEFLP07196 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NEFLP07196 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEFLP07196 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEFLP07196 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEFLP07196 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEFLP07196 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NEFLP07196 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NEFLP07196 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NEFLP07196 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NEFLP07196 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NEFLP07196 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NEFLP07196 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NEFLP07196 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
NEFLP07196 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NEFLP07196 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEFLP07196 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEFLP07196 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEFLP07196 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEFLP07196 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEFLP07196 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NEFLP07196 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NEFLP07196 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NEFLP07196 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NEFLP07196 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NEFLP07196 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NEFLP07196 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NEFLP07196 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NEFLP07196 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NEFLP07196 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NEFLP07196 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NEFLP07196 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
NEFLP07196 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NEFLP07196 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NEFLP07196 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NEFLP07196 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NEFLP07196 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NEFLP07196 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NEFLP07196 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NEFLP07196 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NEFLP07196 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NEFLP07196 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NEFLP07196 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NEFLP07196 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NEFLP07196 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NEFLP07196 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NEFLP07196 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NEFLP07196 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NEFLP07196 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NEFLP07196 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NEFLP07196 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NEFLP07196 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NEFLP07196 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NEFLP07196 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
NEFLP07196 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NEFLP07196 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NEFLP07196 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NEFLP07196 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NEFLP07196 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NEFLP07196 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NEFLP07196 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NEFLP07196 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NEFLP07196 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NEFLP07196 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms