Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPLP06858 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LPLP06858 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPLP06858 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPLP06858 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPLP06858 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPLP06858 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPLP06858 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPLP06858 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPLP06858 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPLP06858 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPLP06858 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPLP06858 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPLP06858 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPLP06858 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPLP06858 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPLP06858 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPLP06858 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPLP06858 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPLP06858 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPLP06858 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPLP06858 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPLP06858 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPLP06858 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPLP06858 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPLP06858 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPLP06858 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LPLP06858 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LPLP06858 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPLP06858 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPLP06858 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPLP06858 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LPLP06858 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
LPLP06858 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LPLP06858 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LPLP06858 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LPLP06858 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LPLP06858 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPLP06858 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPLP06858 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LPLP06858 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPLP06858 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPLP06858 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPLP06858 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LPLP06858 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LPLP06858 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LPLP06858 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPLP06858 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPLP06858 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPLP06858 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LPLP06858 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPLP06858 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LPLP06858 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LPLP06858 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPLP06858 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LPLP06858 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPLP06858 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LPLP06858 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LPLP06858 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPLP06858 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPLP06858 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LPLP06858 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LPLP06858 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPLP06858 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LPLP06858 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPLP06858 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPLP06858 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPLP06858 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LPLP06858 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LPLP06858 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LPLP06858 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LPLP06858 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LPLP06858 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LPLP06858 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LPLP06858 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LPLP06858 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LPLP06858 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LPLP06858 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LPLP06858 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPLP06858 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPLP06858 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPLP06858 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPLP06858 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPLP06858 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPLP06858 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPLP06858 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPLP06858 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPLP06858 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPLP06858 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPLP06858 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPLP06858 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPLP06858 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPLP06858 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPLP06858 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LPLP06858 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LPLP06858 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPLP06858 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPLP06858 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPLP06858 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPLP06858 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms