Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCGP05129 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCGP05129 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms