Protein–RNA interactions for Protein: P04440

HLA-DPB1, HLA class II histocompatibility antigen, DP beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPB1P04440 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPB1P04440 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPB1P04440 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DPB1P04440 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-DPB1P04440 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-DPB1P04440 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DPB1P04440 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DPB1P04440 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DPB1P04440 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DPB1P04440 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DPB1P04440 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DPB1P04440 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DPB1P04440 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DPB1P04440 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms