Protein–RNA interactions for Protein: P01876

IGHA1, Immunoglobulin heavy constant alpha 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHA1P01876 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGHA1P01876 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHA1P01876 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHA1P01876 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHA1P01876 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHA1P01876 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHA1P01876 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGHA1P01876 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHA1P01876 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHA1P01876 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHA1P01876 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHA1P01876 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHA1P01876 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHA1P01876 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHA1P01876 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHA1P01876 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHA1P01876 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHA1P01876 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms